Cursul de Pregătire militară în cadrul Academiei este desfășurat de catedra Instruire militară și intervenții profesionale, în conformitate cu Hotărârea Guvernului Republicii Moldova nr.587 din 20.05.2003 privind aprobarea Regulamentului de funcţionare a catedrelor militare din cadrul instituţiilor de învăţământ superior universitar de stat, Directivei șefului Marelui Stat Major al Armatei Naționale nr.6 din 04 iulie 2019, ordinelor MAI, Regulamentelor şi altor acte legislative.